洁净用房的食品工厂的选址、规划、设计、布局新建和改扩建符合食品卫生生产要求，不会发生污染、交叉污染和混料；厂区的生产环境应整洁，路面及运输不应对食品的生产造成污染。建有洁净用房的食品工厂厂区内的建筑物位置满足了食品生产工艺的需要，在生产区中明确区分了洁净生产区和一般生产区；本工程的洁净生产区包括易腐性食品存冻库、缓化间等处理前的场所；食品加工处理场所；以及最后的包装处理场所。洁净生产区按生产流程及相应洁净用房等级要求合理布局。生产线布置未造成往返交叉和不连续。

在不能最终灭菌食品的生产、检验、包装车间以及易腐败的即食性成品车间的入口处，必须设置独立隔间的手消毒室。生产车间内应划出与生产规模相适应的面积和空间作为物料、中间产品、待验品、成品和洁具的暂存区，并应严防交叉、混淆和污染。

仓储区位置应便于物流管理和卫生管理，各种物料、产品应按品种分类分批储存。同一库内储存将不会相互影响食品风味的物品。储存物料、产品符合先进先出的原则，应便于及时剔除不符合质量和卫生标准的物品。