患者在行造血干细胞移植时，在造血和免疫功能重建之前，由于大剂量化放疗，几乎摧毁了患者的造血功能和免疫防御系统，全血细胞缺乏的严重免疫缺乏状态，病人处于骨髓衰竭，极易发生各种感染及其他并发症。各种病原菌感染是造血干细胞移植中最常见的并发症，也是造血干细胞移植死亡的主要原因之一。根据这一特殊性，对病人实施全环境的保护隔离，也就是需要在专门的造血干细胞移植病房——也称无菌空气层流病房内进行。而空气层流室则是一个相对无菌的病房，包括空气也是经过高效滤过，其内所有物品也经过消毒灭菌处理。利用这个无菌环境减少污染的机会，帮助移植成功。由于该病房要求消毒无菌较普通病房严格，出入病房都有相关规定，所以给患者特别是家属陪伴带来不便，但通过电话、探视窗及监护屏幕是能与亲属保持联系的。

病房经过清洁消毒后，再送入经过高效过滤器过滤的层流空气，以此实现无菌环境，并非是一件难事。但是，在我们身体上寄宿着无数的细菌，尽管在入室前经过各种严格的前处理，仍不可能将人体变成无菌状态。

我国目前尚未有完善的建设标准。1997年实施的《军队医院洁净护理单元建筑技术标准》（YFBOO4-1997简称军标）中，仅对无菌病房的空气洁净度（100级）和细菌浓度（浮游菌<5个/m3，沉降细<1个/Φ90皿·30min）等做了规定。美国建筑师协会（AIA）在2001年版的医院与保健设施设计的建设指南中，已用“无菌病房”称谓。而是将之归类在防护环境病房（ProtectedEnvironmentRoom）中。美国CDC（疾病管理预防中心）和HICPAC（医疗感染管理咨询委员会）则劝告，不要在新建的保护环境室中使用层流空调系统（Laminar air flow systems）并提出了如下具体要还求：

●送风系统在中央或末端，配置高效过滤器（HEPA）。

●必须是气密室。

●保证每小时大于12次换气。

●送风口送出的洁净空气横断病床形成单一方向性气流，从房间的另一侧被排走。

●对前室或走道维持2.5Pa以上正压。

●配置日常监视系统，记录监视结果。

●全部病房出入口均需配置自动门。